Журнал «Вестник Самарского государственного университета» основан в 1995 г. Самарским государственным университетом (Свидетельство о регистрации журнала

ПИ № 77-12398 от 19.04.2002 г., выдано Министерством Российской Федерации по делам печати, телерадиовещания и средств массовой коммуникации, ISSN 1810-5378). Выходил в двух сериях: естественнонаучной и гуманитарной. С  2011 г. из гуманитарной серии была выделена серия «Экономика и управление». С 2015 г. журнал был разделен на четыре самостоятельных журнала: «Вестник Самарского государственного университета»; «Вестник Самарского государственного университета. Естественнонаучная серия», «Вестник Самарского государственного университета. Серия "Экономика и управление"», «Юридический вестник Самарского государственного университета».

С 2016 г. в связи с реорганизацией вуза и сменой учредителя журнал «Вестник Самарского государственного университета. Естественнонаучная серия» был перерегистрирован под названием «Вестник Самарского университета. Естественнонаучная серия / Vestnik of Samara University. Natural Science Series».

Свидетельство о регистрации журнала ПИ № ФС 77-67328 от 05.10.2016 г., выдано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций

Журнал  включен ВАК РФ в Перечень ведущих научных журналов и изданий, выпускаемых в РФ, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание ученой степени доктора наук и кандидата наук с 2003 г., как входящий в международную базу данных zbMATH.